「全て削除」ボタンを透過します。


SystemUI.apk eslayoutstatus_bar_expanded_header.xml
の
<Button android:id="@id/clear_all_button" ～
を
<Button android:id="@id/clear_all_button" android:background="#00000000" ～
のようにすると透過できます。
※この数字を変えると透過度を変更出来ます。

完全に透過したSystemUI.apkはここからダウンロードできます。
(ステータスバー透過済み、#7f000000になっています)

追記:
通知領域に表示されるアイコンの背景が透過されていませんでした。
framework-res.apk esaluesdrawables.xml
の一番下にある二つを
<item type="drawable" name="notification_template_icon_bg">#00000000</item>
<item type="drawable" name="notification_template_icon_low_bg">#00000000</item>
のようにすると透過できます。