Xperiaシリーズでは2012年モデルからframework-res.apkの編集には一手間かける必要があります。
[追記]
apktool v2では修正されており、以下の操作は必要ありません。

従来であればとするだけで良かったのですが、テーマ背景の読み込み方法が変わったため
このままでは背景画像を読み込めずブートループとなってしまいます。

これを回避するにはいくつか方法がありますが、
framework-res.apkを編集して回避するにはまず
/framework-res.apk/apktool.ymlの
usesFramework:を削除して保存してください。

次に/framework-res.apk/res/values/styles.xmlの
@com.sonyericsson.uxp:drawable/semc_bgを
@drawable/semc_bgにして、
@com.sonyericsson.uxp:drawable/semc_bg_brightを
@drawable/semc_bg_brightにしてください。

黒/白の背景画像をダウンロードして
semc_bg.png、semc_bg_bright.pngをdrawable-nodpi、
semc_bg1.pngをdrawable-land-xhdpi
にコピーしてください。
[追記]
semc_bg1.pngはsemc_bg.pngに名前を変えてください。間違えていました…。

最後にテキスト検索/置換ソフト(Devasなど)で
@com.sonyericsson.uxp:color/semc_theme_accent_color
を
@color/white
などに置換してください。(59箇所あります)
この色はオン/オフボタンなどの色に使われます。
色一覧

white	■	#ffffffff
black	■	#ff000000
holo_blue_bright	■	#ff00ddff
holo_blue_light	■	#ff33b5e5
holo_blue_dark	■	#ff0099cc
holo_green_light	■	#ff99cc00
holo_green_dark	■	#ff669900
holo_red_light	■	#ffff4444
holo_red_dark	■	#ffcc0000
holo_orange_light	■	#ffffbb33
holo_orange_dark	■	#ffff8800
holo_purple	■	#ffaa66cc

これで正常にコンパイルでき、ブートループも起きなくなります。